Grado en Ingeniería Telemática (E.P.S. Linares)

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Infraestructura Cloud para su uso en bioinformática
(2018-03-06) Martos Velasco, María Teresa; Muñoz Expósito, José Enrique; Fernández Ocaña, Ana María; Universidad de Jaén. Ingeniería de Telecomunicación
[ES]El objetivo de este proyecto es crear una infraestructura cloud para la ejecución de distintas aplicaciones bioinformáticas. Una de las aplicaciones, llamada BLAST, se encargará de realizar el alineamiento de muestras de nucleótidos y proteínas. La otra aplicación, conocida como Trinity, realiza la secuenciación De novo del ARN a partir de un conjunto de muestras problema extraídas y purificadas de las células. La infraestructura cloud se construirá utilizando OpenNebula. En dicha infraestructura se ejecutarán una colección de máquinas virtuales las cuales serán gestionadas mediante un sistema gestor de recursos distribuidos llamado Open Grid Scheduler. Así, se creará un grid de máquinas virtuales que ejecutarán en paralelo y de manera distribuida las tareas asociadas a la secuenciación. Se propone, además, construir una interfaz de usuario utilizando para ello una aplicación web. Se crearán lo distintos menú y elementos necesarios para poder interactuar con estas herramientas bioinformáticas.