Caracterización de ADNs satélite en insectos usando herramientas bioinformáticas: Satelitoma de Aphaenogaster gibbosa (Hymenoptera, Formicidae)

Abstract

[ES] En este Trabajo Fin de Grado se llevó a cabo la caracterización bioinformática del satelitoma en la especie de hormiga Aphaenogaster gibbosa. Tradicionalmente, el ADN satélite se consideraba "basura" y que carecía de función en el genoma. Sin embargo, investigaciones recientes han demostrado su importancia en el mantenimiento de la estructura y función del cromosoma, lo que ha impulsado el estudio del ADN repetitivo. Anteriormente, el aislamiento del ADN satélite se realizaba mediante la digestión del ADN genómico con enzimas de restricción, pero esta técnica no era muy eficiente. Actualmente, el desarrollo de técnicas de secuenciación masiva de genomas (NGS) y el uso de software especializado han permitido el estudio del ADN satélite sin necesidad de ensamblar genomas completos. En Aphaenogaster gibbosa se secuenció su genoma utilizando la plataforma Illumina. Los datos obtenidos se analizaron mediante el software RepeatExplorer para identificar las secuencias de ADN satélite. Este estudio reveló la presencia de 48 familias diferentes de ADN satélite en Aphaenogaster gibbosa, representando un avance significativo en la caracterización del satelitoma en hormigas de la familia Formicidae.

[EN] In this Bachelor's thesis, the bioinformatic characterization of the satellitome was carried out in the ant species Aphaenogaster gibbosa. Traditionally, satellite DNA was considered "junk" and believed to lack function in the genome. However, recent research has demonstrated its importance in maintaining chromosome structure and function, which has driven the study of repetitive DNA. Previously, satellite DNA isolation was performed through the digestion of genomic DNA with restriction enzymes, but this technique was not very efficient. Nowadays, the development of Next‐Generation Sequencing (NGS) techniques and the use of specialized software have enabled the study of satellite DNA without the need for complete genome assembly. The genome of Aphaenogaster gibbosa was sequenced using the Illumina platform. The obtained data were analyzed using RepeatExplorer software to identify satellite DNA sequences. This study revealed the presence of 48 different families of satellite DNA in Aphaenogaster gibbosa, representing a significant advancement in the characterization of the satellitome in ants of the Formicidae family.