Caracterización de ADNs satélite en insectos usando herramientas bioinformáticas: Satelitoma de Cataglyphis hispanica (Hymenoptera, Formicidae)

Abstract

[ES] En el presente Trabajo Fin de Grado se ha realizado con éxito la caracterización del conjunto de todas las familias de ADN satélite (satelitoma) de la especie Cataglyphis hispanica. El ADN satélite desempeña funciones relacionadas con la organización estructural de los cromosomas y su correcta segregación entre otras. Sin embargo, tradicionalmente se le ha considerado como ADN “basura” al no atribuírsele ningún tipo de función, provocando cierto desinterés en comparación con el ADN codificante. El estudio del ADN satélite se ha basado principalmente en el uso de enzimas de restricción que cuyas limitaciones han sido superadas por la aparición de las tecnologías de secuenciación masiva (NGS) y el desarrollo de herramientas bioinformáticas especializadas. La especie Cataglyphis hispanica es una hormiga de la familia Formicidaeendémica de la península ibérica cuyo genoma ha sido secuenciado mediante tecnología Illumina. Se analizaron estas lecturas mediante el uso de la plataforma RepeatExplorer, cuyos resultados muestran un satelitoma representado por 52 familias. Esto convierte a C.hispanica en la primera especie del género Cataglyphis cuyo satelitoma ha sido caracterizado. [EN] In this Bachelor ́s thesis, the complete characterization of all satellite DNA families (satellitome) of the species Cataglyphis hispanica has been successfully carried out. Satellite DNA plays important roles related to the structural organization of chromosomes and their proper segregation, among others. However, it has traditionally been considered due to the lack of attributed functions, ledding to a relative d¡disinterest compared to coding DNA. The SatDNA ́s study was based mainly on the use of restriction enzymes whose limitations have been overcome with the emergence of Next-Generation sequencing (NGS) technologies and the development of specialized bioinfomatic tool, such as, RepeatExplorer, which have enabled more exhaustive satellitome analysis in many species. Cataglyphis hispanica is an ant species endemic to the Iberian Peninsula, belonging to the Formicidae family, whose genome has been sequenced using Illumina technology. Illumina reads were analyzed using RepeatExplore platform. The results revealed that the satellitome was composed of 52 distinct satDNA families. This makes C. hispanica the first species in the genus Cataglyphis whose satellitome has been fully characterized.