Secuenciación de novo de genomas de plantas

Abstract

[ES] La secuenciación del genoma se lleva a cabo mediante una serie de técnicas para determinar la secuencia genómica de un individuo. Durante los últimos 50 años, la tecnología ha evolucionado y perfeccionando estos métodos, haciendo que se obtengan lecturas de gran tamaño en muy poco tiempo, avanzando desde la secuenciación de Sanger hasta la más reciente Oxford Nanopore Technology, pasando por Illumina, la que posee mayor relevancia en la actualidad. También se profundiza en la importancia de los genomas vegetales. Debido a su naturaleza repetitiva y su poliploidía, se ha tenido que poner a prueba y mejorar cada tecnología, hasta el punto de haber sido secuenciados en su totalidad prácticamente. También cabe mencionar la importancia de las plantas modelo como Arabidopsis thaliana, la cual fue elegida gracias a su corto ciclo de vida y pequeño tamaño del genoma a la hora de ser secuenciada, y que sirvió de modelo para la secuenciación del resto de genomas de plantas que se conocen en la actualidad.

[EN] Genome sequencing is carried out using different techniques to determine the genomic sequence of an individual. During the last 50 years, technology has evolved and refined these methods, obtaining large readings in a very short time, advancing from Sanger sequencing to the most recent Oxford Nanopore Technology, passing through Illumina, the one with the biggest relevance today. The importance of plant genomes is also explored in this work. Due to its repetitive nature and polyploidy, it has been needed to test and improve that technology, making easier to practically complete a plant genome sequence. It is also worth mentioning the importance of model plants such as Arabidopsis thaliana, which was chosen due to its short life cycle and the small size of the genome at the time of being sequenced, and that served as a model for the sequencing of the rest of the plant genomes that are currently known.