Análisis transcriptómico mediante RNAseq en el olivo
Fecha
2014-09-15
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Editor
Jaén: Universidad de Jaén
Resumen
[ES]El olivo es considerado uno de los árboles frutales más importantes a nivel mundial, por su alto valor económico y nutricional. Los cultivos y sus productos son dañados por numerosas enfermedades y plagas, siendo la patología más importante la Verticilosis causada por el hongo del suelo Verticillium dahliae. Determinadas variedades de esta planta responden de forma diferencial al parásito, siendo algunas de ellas más resistentes, como es el caso de la variedad “Frantoio”, y otras más susceptibles como la variedad “Picual”. El estudio de la interacción entre el parásito y la planta a través de nuevas herramientas transcriptómicas como el RNA-seq, constituyen el principal objetivo de la Fitopatología. Ésta permite analizar los niveles de expresión de miles de transcritos en una gran diversidad de situaciones. En el presente trabajo se ha ensamblado un transcriptoma completo que permitirá un amplio estudio de la interacción planta-patógeno en una variedad tolerante y en una susceptible.
[EN]El olivo es considerado uno de los árboles frutales más importantes a nivel mundial, por su alto valor económico y nutricional. Los cultivos y sus productos son dañados por numerosas enfermedades y plagas, siendo la patología más importante la Verticilosis causada por el hongo del suelo Verticillium dahliae. Determinadas variedades de esta planta responden de forma diferencial al parásito, siendo algunas de ellas más resistentes, como es el caso de la variedad “Frantoio”, y otras más susceptibles como la variedad “Picual”. El estudio de la interacción entre el parásito y la planta a través de nuevas herramientas transcriptómicas como el RNA-seq, constituyen el principal objetivo de la Fitopatología. Ésta permite analizar los niveles de expresión de miles de transcritos en una gran diversidad de situaciones. En el presente trabajo se ha ensamblado un transcriptoma completo que permitirá un amplio estudio de la interacción planta-patógeno en una variedad tolerante y en una susceptible.
[EN]El olivo es considerado uno de los árboles frutales más importantes a nivel mundial, por su alto valor económico y nutricional. Los cultivos y sus productos son dañados por numerosas enfermedades y plagas, siendo la patología más importante la Verticilosis causada por el hongo del suelo Verticillium dahliae. Determinadas variedades de esta planta responden de forma diferencial al parásito, siendo algunas de ellas más resistentes, como es el caso de la variedad “Frantoio”, y otras más susceptibles como la variedad “Picual”. El estudio de la interacción entre el parásito y la planta a través de nuevas herramientas transcriptómicas como el RNA-seq, constituyen el principal objetivo de la Fitopatología. Ésta permite analizar los niveles de expresión de miles de transcritos en una gran diversidad de situaciones. En el presente trabajo se ha ensamblado un transcriptoma completo que permitirá un amplio estudio de la interacción planta-patógeno en una variedad tolerante y en una susceptible.