Expresión diferencial de genes de reparación del ADN en variedades de olivo.

Abstract

[ES] El proceso de domesticación del olivo estuvo caracterizado por una alta actividad de transposones. Esta actividad de transposones resultó ser más elevada en las variedades incluidas en un grupo emparentado filogenéticamente (Cluster 3). El siguiente trabajo se desarrolla bajo la hipótesis de que el genoma del olivo se encuentra sometido a un estrés mutacional ocasionado por roturas en el DNA derivadas de la elevada actividad de transposición. Para determinar dicho estrés mutacional, se realizó el análisis de la expresión génica mediante RNA-Seq. Se encontró 1118 genes expresados diferencialmente, de los cuales, 18 genes están involucrados en la reparación del DNA. De estos 18 genes, encontramos 7 genes implicados en la reparación de roturas en la doble cadena, de los cuales, además, un gen interviene también en la reparación de roturas de una sola cadena. Los 11 genes restantes están involucrados en otros procesos de la reparación.

[EN] The olive domestication process was characterised by high transposon activity. This transposon activity was found to be higher in varieties included in a phylogenetically related group (Cluster 3). The following work is developed under the hypothesis that the olive genome is under mutational stress caused by DNA breaks resulting from high transposon activity. To determine this mutational stress, gene expression was analysed by RNA-Seq. We found 1118 differentially expressed genes, of which 18 genes are involved in DNA repair. Of these 18 genes, we found 7 genes involved in the repair of double-strand breaks, of which, in addition, one gene is also involved in the repair of single-strand breaks. The remaining 11 genes are involved in other repair processes.